מס שמנוכה אוטומטית על ידי הגורם המשלם (למשל ברוקר או מעסיק) לפני שהכסף מגיע בכלל לידי מקבלו, ולא משולם בדיעבד על ידי מקבל התשלום.
מס במקור מיושם באופן נרחב בעולם ההשקעות הבינלאומי - כשמשקיע זר מקבל דיבידנד או ריבית ממדינה אחרת, המדינה המקורית מנכה חלק מהתשלום כמס עוד לפני שהכסף עובר גבול. שיעור הניכוי במקור נקבע לרוב לפי אמנת מס בין שתי המדינות, ולעיתים ניתן לתבוע החזר חלקי או לקזז אותו מול חבות מס במדינת התושבות של המשקיע, כדי למנוע מיסוי כפול על אותה הכנסה.
משקיע ישראלי שמקבל דיבידנד ממניה אמריקאית רואה בפועל רק 75 דולר מכל 100 דולר דיבידנד שהוכרז - 25 הדולרים הנותרים נוכו כמס במקור על ידי הברוקר האמריקאי לפני שהכסף בכלל הגיע אליו.